MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 9339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017474	TA	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017474	TCA	2	6	17	22	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017474	GGA	2	6	66	71	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017474	GTT	3	9	1504	1512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017474	CTATTA	2	12	1543	1554	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017474	TATAT	2	10	1567	1576	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017474	AGG	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017474	CAA	2	6	2753	2758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017474	A	6	6	2771	2776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017474	AG	3	6	2783	2788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017474	TGA	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017474	T	6	6	2808	2813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017474	ATA	3	9	2861	2869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017474	ACGT	2	8	2961	2968	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017474	GAA	2	6	2976	2981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017474	TAG	3	9	3007	3015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017474	TCC	2	6	3027	3032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017474	AT	3	6	3033	3038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017474	ATA	3	9	3077	3085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017474	AT	3	6	3094	3099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017474	ATA	2	6	3112	3117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017474	AAAAGT	2	12	3348	3359	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017474	AGT	2	6	3498	3503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017474	TAAT	2	8	3513	3520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017474	GAC	2	6	3532	3537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017474	TGA	2	6	4959	4964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017474	AGG	2	6	5033	5038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017474	GAG	2	6	7051	7056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017474	TAA	2	6	9693	9698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017474	TTTG	2	8	9774	9781	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017474	TCC	2	6	10506	10511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017474	GCAA	2	8	10590	10597	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017474	AGA	2	6	10604	10609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017474	TGC	2	6	10644	10649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017474	AGG	2	6	10668	10673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017474	CGC	2	6	11124	11129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017474	AGG	2	6	11226	11231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017474	T	6	6	11545	11550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017474	GGA	2	6	12239	12244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017474	A	7	7	12497	12503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017474	T	7	7	12535	12541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017474	ATT	2	6	12542	12547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017474	A	6	6	12552	12557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017474	AGA	2	6	12612	12617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017474	ATTA	2	8	12658	12665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017474	GAA	2	6	12681	12686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017474	TAG	2	6	12745	12750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017474	TA	3	6	12819	12824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017474	TAA	2	6	12826	12831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017474	TGT	2	6	12841	12846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017474	GGA	2	6	12874	12879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017474	GTCGA	2	10	14527	14536	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017474	ATA	2	6	14606	14611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017474	TA	3	6	14615	14620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017474	CAA	2	6	14719	14724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017474	GGT	2	6	14751	14756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017474	AAT	2	6	15066	15071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017474	T	6	6	15130	15135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017474	AACG	2	8	15202	15209	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017474	AGC	2	6	15237	15242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017474	TA	3	6	15284	15289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017474	ATT	2	6	15344	15349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017474	GCG	3	9	17861	17869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017474	AAG	2	6	17872	17877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017474	T	7	7	18127	18133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017474	GAA	2	6	18856	18861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017474	AAGC	2	8	18872	18879	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017474	A	6	6	18907	18912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017474	TC	3	6	18919	18924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017474	A	6	6	18933	18938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017474	CAT	2	6	18945	18950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017474	TTG	2	6	18951	18956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017474	TAA	2	6	19017	19022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017474	TG	3	6	19023	19028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017474	AAC	2	6	19079	19084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017474	ATT	2	6	19138	19143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017474	TAAT	2	8	19639	19646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017474	AT	3	6	19645	19650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017474	AC	3	6	19689	19694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017474	CAA	2	6	20123	20128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017474	AGC	2	6	20203	20208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017474	A	8	8	20226	20233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017474	CGTT	2	8	20293	20300	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017474	A	6	6	20302	20307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017474	A	6	6	21196	21201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017474	TTC	2	6	21235	21240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017474	T	6	6	21460	21465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017474	CCT	2	6	21683	21688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017474	AGCT	2	8	21732	21739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017474	TA	3	6	21786	21791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017474	GAT	2	6	21915	21920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017474	CAG	3	9	21921	21929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017474	CGAG	2	8	21942	21949	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017474	CCT	2	6	22038	22043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017474	A	7	7	22052	22058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017474	CTT	2	6	22095	22100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017474	GGGT	2	8	22159	22166	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017474	TGA	2	6	23554	23559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017474	A	6	6	23570	23575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017474	GAC	2	6	23586	23591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017474	CCT	2	6	26906	26911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017474	TG	3	6	26930	26935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017474	GTTTT	2	10	27130	27139	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017474	ATG	2	6	27160	27165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017474	GGA	2	6	27169	27174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017474	ATA	2	6	27756	27761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017474	GGTT	2	8	28926	28933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017474	T	6	6	28945	28950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017474	CATA	2	8	28972	28979	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017474	AGA	2	6	28986	28991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017474	T	6	6	29035	29040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017474	GTT	2	6	29051	29056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017474	AGTG	2	8	29118	29125	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017474	CCT	2	6	30256	30261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017474	TAT	2	6	32433	32438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017474	TG	3	6	32442	32447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017474	CTC	2	6	33379	33384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017474	AC	3	6	33461	33466	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017474	GAA	2	6	33543	33548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017474	AAT	2	6	34167	34172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017474	TTCTT	2	10	34193	34202	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017474	ATGA	2	8	34207	34214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017474	AGC	2	6	35215	35220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017474	CAA	2	6	35909	35914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017474	AAGC	2	8	35973	35980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017474	CA	3	6	36088	36093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017474	AGCA	2	8	37479	37486	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017474	ATTT	2	8	37527	37534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017474	TCA	2	6	37553	37558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017474	TA	3	6	37605	37610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017474	AG	3	6	38052	38057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017474	AAAC	2	8	38564	38571	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017474	CT	3	6	38641	38646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017474	CAT	2	6	38659	38664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017474	AAG	2	6	40191	40196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017474	A	7	7	40206	40212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017474	TCA	2	6	40240	40245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017474	AGAA	2	8	40297	40304	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017474	AGC	2	6	41018	41023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017474	TAG	2	6	41367	41372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017474	ACA	2	6	41387	41392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017474	TAA	2	6	41396	41401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017474	TAA	2	6	41419	41424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017474	TA	3	6	41461	41466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017474	TGG	2	6	41498	41503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017474	ATT	2	6	41509	41514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017474	AAG	2	6	41726	41731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017474	CTT	2	6	41763	41768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_017474	ATT	2	6	76459	76464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_017474	GGAGAA	2	12	77598	77609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_017474	CAA	2	6	121542	121547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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438	NC_017474	AAT	2	6	121674	121679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_017474	TA	3	6	121691	121696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_017474	T	7	7	124064	124070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_017474	ATA	2	6	125805	125810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_017474	ATT	2	6	129900	129905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_017474	AAAT	2	8	132742	132749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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